Kullanıcı Henüz Hiçbir Şey Paylaşmadı.


    Kullanıcı Henüz Hiçbir Bilgi Paylaşmadı.


Kullanıcı Henüz Hiçbir Albüm Paylaşmadı.

Duyurular

Yayınlar

      Sizden Bahsedenler

      Özgeçmiş

      Doç. Dr. Sezer OKAY

      Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü
      Moleküler Biyoloji Anabilim Dalı


      Eğitim Durumu:

      Lisans: Anadolu Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü, Eskişehir.

      Yüksek Lisans: Orta Doğu Teknik Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim Dalı, Ankara.

      Doktora: Orta Doğu Teknik Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim Dalı, Ankara.

      Akademik ve Meslekte Deneyim:

      Araştırma Görevlisi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Ankara.

      Misafir Araştırmacı, CreSA, Universitat Autonoma de Barcelona (UAB), Barselona, İspanya.

      Araştırma Görevlisi Dr., Moleküler Biyoloji Anabilim Dalı, Biyoloji Bölümü, Fen Fakültesi, Atatürk Üniversitesi, Erzurum.

      Yrd. Doç. Dr., Moleküler Biyoloji Anabilim Dalı, Biyoloji Bölümü, Fen Fakültesi, Çankırı Karatekin Üniversitesi, Çankırı.

      Doç. Dr., Moleküler Biyoloji Anabilim Dalı, Biyoloji Bölümü, Fen Fakültesi, Çankırı Karatekin Üniversitesi, Çankırı.

      İdari Görev:

      2016 - Devam: Çankırı Karatekin Üniversitesi Araştırma Merkezi (ÇANKAM) Müdür V.

      Uzmanlık Alanları:

      • Genetik mühendisliği
      • Genomik, Transkriptomik ve Biyoinformatik
      • Protein ve enzim çalışmaları
      • Rekombinant aşı geliştirme ve bağışıklık yanıtın belirlenmesi


      Verdiği Dersler:

      • Lisans:
        • BİY151 Genel Biyoloji Lab. I
        • BİY152 Genel Biyoloji Lab. II
        • BİY309 Biyokimya I
        • BİY302 Genetik II
        • BİY307 Moleküler Biyoloji I
        • BİY425 Biyoloji Araştırma Projesi I
        • BİY404 Biyoloji Araştırma Projesi II


        Yüksek Lisans:

        • BİY547 Metabolik Mühendisliği
        • BİY548 Rekombinant Aşı Geliştirme
        • BİY549 Sekonder Metabolitler


      Yurtdışı Araştırma Faaliyeti:

      CReSA (Hayvan Sağlığı Araştırma Merkezi), UAB (Barselona Otonom Üniversitesi), Barselona (İspanya)’da bir yıl Dr. Fernando Rodriguez ile DNA aşısı stratejileri üzerine çalışmalar.

      Yabancı Dil:

      • İngilizce: Çok iyi
      • İspanyolca: İyi

      Eserler:

      Tezler:

      Lisans Bitirme Araştırması: Kekik (Origanum onites) yağının mutajenik ve antimutajenik etkisisnin Ames Testi ile değerlendirilmesi.

      Yükseklisans Tezi: Cloning of chitinase A (chiA) gene of Serratia marcescens Bn10 and its expression in Coleoptera-specific Bacillus thuringiensis.
      [Kitinaz A (chiA) geninin Serratia marcescens Bn10’dan klonlanması ve Coleoptera-spesifik Bacillus thuringiensis’te ifade edilmesi]

      Doktora Tezi: Development of recombinant vaccines composed of PlpE and OmpH from Pasteurella multocida A:3
      [Pasteurella multocida A:3’e ait PlpE ve OmpH’den oluşan rekombinant aşıların geliştirilmesi]


      Makaleler:

      1. Ipek, E., Zeytinoglu, H., Okay, S., Tuylu, B.A., Kurkcuoglu M. and Baser, K.H.C. (2005). Genotoxicity and antigenotoxicity of Origanum oil and carvacrol evaluated by Ames Salmonella/microsomal test. Food Chemistry 93(3): 551–556.

      2. Okay, S., Tefon, B.E., Ozkan M. and Ozcengiz, G. (2008). Expression of chitinase A (chiA) gene from a local isolate of Serratia marcescens in Coleoptera-specific Bacillus thuringiensis. Journal of Applied Microbiology 104: 161–170.

      3.Özcengiz, G., Okay, S., Ünsaldı, E., Taşkın, B., Liras, P., Piret, J. (2010). Homologous expression of aspartokinase (ask) gene in Streptomyces clavuligerus and its hom-deleted mutant: Effects on cephamycin C production. Bioengineered Bugs 1 (3): 191-197.

      4. Okay, S.*, Özcengiz, G. (2011). Molecular cloning, characterization and homologous expression of an endochitinase gene from Bacillus thuringiensis serovar morrisoni. Turkish Journal of Biology 35: 1-7.

      5. Okay, S., Özcengiz, E., Gürsel, İ., Özcengiz, G. (2012). Immunogenicity and protective efficacy of the recombinant Pasteurella lipoprotein E and outer membrane protein H from Pasteurella multocida A:3 in mice. Research in Veterinary Science 93: 1261-1265.

      6. Okay, S., Özcengiz, E., Özcengiz, G. (2012). Immune responses against chimeric DNA and protein vaccines composed of PlpEN-OmpH and PlpEC-OmpH from Pasteurella multocida A:3 in mice. Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica 59 (4): 485-498.

      7. Eldem, V., Okay, S., Ünver, T. (2013). Plant microRNAs: New players in functional genomics. Turkish Journal of Agriculture and Forestry 37: 1-21.

      8. Okay, S., Ozdal, M., Kurbanoglu, E. B. (2013). Characterization, antifungal activity and cell immobilization of a chitinase from Serratia marcescens MO-1. Turkish Journal of Biology 37: 639-644.

      9. Ozhuner, E., Eldem, V., Ipek, A., Okay, S., Sakcali, S., Zhang, B., Boke, H., Unver, T. (2013). Boron stress responsive microRNAs and their targets in barley. PLoS ONE 8(3): e59543.

      10. Turktas, M., Inal, B., Okay, S., Erkilic, E.G., Dundar, E., Hernandez, P., Dorado, G., Unver, T. (2013). Nutrition metabolism plays an important role in the alternate bearing of the olive tree (Olea europaea L.). PLoS ONE 8(3): e59876.

      11. Okay, S.*, Derelli, E., Unver, T. (2014). Transcriptome-wide identification of bread wheat WRKY transcription factors in response to drought stress. Molecular Genetics and Genomics 289 (5): 765-781. DOI: 10.1007/s00438-014-0849-x.

      12. Inal, B., Turktas, M., Eren, H., Ilhan, E., Okay, S., Atak, M., Erayman, M., Unver, T. (2014). Genome-wide fungal stress responsive miRNA expression in wheat. Planta 240 (6): 1287-1298. DOI: 10.1007/s00425-014-2153-8.

      13. Eren, H., Pekmezci, M.Y., Okay, S., Turktas, M., Inal, B., Ilhan, E., Atak, M., Erayman, M., Unver, T. (2015). Hexaploid wheat (Triticum aestivum L.) root miRNome analysis in response to salt stress. Annals of Applied Biology 167 (2): 208-216. DOI: 10.1111/aab.12219

      14. Okay, S.*, Kurt Kızıldoğan, A. (2015). Comparative genome analysis of five Pasteurella multocida strains to decipher the diversification in pathogenicity and host specialization. Gene 567: 58-72. DOI: 10.1016/j.gene.2015.04.063

      15. Gurkok, T., Ozhuner, E., Parmaksiz, I., Özcan, S., Turktas, M., İpek, A., Demirtas, I., Okay, S., Unver, T. (2016). Functional characterization of 4`OMT and 7OMT genes in BIA biosynthesis. Frontiers in Plant Science 7: 98. DOI: 10.3389/fpls.2016.00098.

      16. Okay, S. (2016). In silico characterization of the citrate synthase family in Mycobacterium tuberculosis. Turkish Journal of Biochemistry 41 (2): 118–126. DOI: 10.1515/tjb-2016-0019.

      17. Kurt Kızıldoğan, A., Abanoz, B., Okay, S.* (2017). Global transcriptome analysis of Halolamina sp. to decipher the salt tolerance in extremely halophilic archaea. Gene 601: 56-64 DOI: 10.1016/j.gene.2016.11.042.


      Uluslararası Kongre Sunumları:

      Sözlü sunum:

      1. Okay, S., Özcengiz, E., Özcengiz, G. (2010). Development of new vaccine strategies against Pasteurella multocida. Prato Conference on the Pathogenesis of Bacterial Diseases of Animals (6-9 Ekim 2010, Prato, İtalya) Özet Kitabı, sayfa 47.

      2. Okay, S., Kurt Kizildogan, A., Abanoz, B. (2016). Differential gene expression in Halolamina sp. in response to excess salt. The FEBS Journal 283 (Suppl. 1): 89.

      3. Kurt Kizildogan, A., Otur, Ç., Bas, L., Abanoz, B., Okay, S. (2016). Regulation of siderophore biosynthesis by different transcriptional regulators in Streptomyces clavuligerus. The FEBS Journal 283 (Suppl. 1): 83.

      Poster sunumları:

      1. Okay, S., Ipek, E., Zeytinoğlu, H., Kurkcuoğlu, M. (2003). Antimutagenicity testing of Origanum oil and carvacrol in the Ames assay. 13th Balkan Biochemical Biophysical Days & Meeting on Metabolic Disorders (12–15 Ekim 2003, Aydın) Program & Özetler. Türk Biyokimya Dergisi 28(3): 140.

      2. Okay, S., Ozkan, M., Ozcengiz, G. (2006). Expression of an endochitinase (chiA) gene from Serratia marcescens Bn10 in a Cry3A producer Bacillus thuringiensis. 2nd FEMS Congress of European Microbiologists (4–8 Temmuz 2006 Madrid, İspanya) Özet Kitabı, sayfa 124.

      3. Okay S., Ozcengiz G. (2008). Characterization and homologous expression of endochitinase gene (chi3023) from Bacillus thuringiensis serovar morrisoni. XII. International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology (5–9 Ağustos 2008 İstanbul) Özet Kitabı, sayfa 75.

      4. Ünsaldı, E., Okay, S., Özcengiz, G. (2008). Cephamycin C overproduction upon releasing relaxing precursor flux by genetic engineering and medium formulation. XII. International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology (5–9 Ağustos 2008 İstanbul) Özet Kitabı, sayfa 98.

      5. Okay, S., Aragon, V., Rosell, R., Pujols, J., Ozcengiz, G., Rodriguez, F. (2009). Use of FHA from Bordetella bronchiseptica as an adjuvant to improve DNA vaccination in small and large animals. 3rd annual meeting EPIZONE “Crossing borders” (12-15 May 2009, Antalya) Özet Kitabı, sayfa 137.

      6. Okay, S., Ünsaldı, E., Taşkın, B., Kurt, A., Piret, J., Liras, P., Özcengiz, G. (2009). Metabolic engineering of aspartate pathway for increased production of cephamycin C in Streptomyces clavuligerus. International Symposium on Biotechnology: Developments and Trends (27-30 Eylül 2009, ODTÜ, Ankara) Özet Kitabı, sayfa: 99.

      7. Okay, S. (2014). Development of recombinant DNA vaccines. 3rd International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey. (10-12 September 2014, İzmir, Turkey). Abstract Book p. 187.

      8. Okay, S. (2015). Bioinformatic analysis of the citrate synthase proteins in Mycobacterium tuberculosis. 4th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey. (27-29 Kasım 2015, Ankara). Abstract Book p. 76.


      Ulusal Kongre Sunumları:

      Sözlü sunumlar:

      1. Okay, S., Özcengiz, G. (2007). Bacillus thuringiensis alttür morrisoni kitinaz geninin karakterizasyonu. 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (28–31 Ekim, Antalya). Bildiri Kitabı, sayfa: 303–306.

      2. Ünsaldı, E., Okay, S., Özcengiz, G. (2009). Yabanıl tip Streptomyces clavuligerus ve hom geni delesyona uğramış mutantında aspartokinaz (ask) geni çoklu kopyasının homolog ekspresyonu: Hücre içi serbest aminoasit seviyesindeki değişimler. 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (13-16 Aralık, Antalya). Bildiri Kitabı, sayfa: 314-317.

      3. Okay, S., Özcengiz, E., Gürsel, İ., Özcengiz, G. (2012). Pasteurella multocida’ya karşı rekombinant aşı geliştirilmesinde farklı adjuvanların rolü. 2. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi (15-18 Kasım, Antalya). Bildiri Özetleri Kitabı sayfa: 52.

      4. Okay, S. (2015). Ulusal rekombinant tüberküloz aşısına ilk adım. 7. Ulusal Mikobakteri sempozyumu (8-10 Mayıs 2015, Mersin). Sempozyum Kitabı sayfa 151.

      5. Okay, S., Kurt Kızıldoğan, A. (2015). Beş farklı Pasteurella multocida suşunun karşılaştırmalı genom analizi. 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (18-19 Aralık 2015, Konya). Bildiriler Kitabı sayfa 260.

      6. Kurt Kızıldoğan, A., Abanoz, B., Okay, S. (2015). Ekstrem halofilik arkeon Haloarcula sp. tarafından üretilen proteaz enziminin karakterizasyonu. 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (18-19 Aralık 2015, Konya). Bildiriler Kitabı sayfa 185.

      7. Okay, S., Kurt Kızıldoğan, A., Abanoz, B. (2016). Ekstrem halofilik arkebakterilerin biyoteknolojik öneme sahip enzim üretimlerinin araştırılması. I. Ulusal Tarımsal Biyoteknoloji Kongresi (1-3 Haziran 2016 Samsun). Bildiri Özetleri Kitabı sayfa 2.

      Poster sunumları:

      1. Okay, S., Özkan, M., Özcengiz, G. (2005). Kitinaz A geninin Serratia marcescens`ten klonlanması ve Coleoptera-spesifik Bacillus thuringiensis`te ifade edilmesi. 14. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (31 Ağustos-2 Eylül, Eskişehir) Bildiri ve Poster Kitabı, sayfa: 586.

      2. Okay, S., Tefon, B.E., Özkan, M., Özcengiz, G. (2007). Serratia marcescens Kitinaz A Geninin Rekombinant Bacillus thuringiensis`te Ekspresyonunun Analizi. 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (28–31 Ekim, Antalya). Bildiri Kitabı, sayfa: 44.

      3. Okay, S., Özcengiz, E., Özcengiz, G. (2009). Pasteurella multocida P-1062 suşuna ait ompH geninin klonlanması ve biyoinformatik analizi. 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (13-16 Aralık, Antalya). Bildiri Kitabı, sayfa: 15.

      4. Okay, S., Baloğlu, M.C., Eroğlu, A., Battal, A., Özcengiz, G., Öktem, H.A., Yücel, M. (2009). Serratia marcescens’e ait kitinaz A geninin tütün bitkisine aktarılması. 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (13-16 Aralık, Antalya). Bildiri Kitabı, sayfa: 14-15.

      5. Yılmaz, Ç., Okay, S., Tefon, B. E., Özcengiz, E., Özcengiz, G. (2009). Bordetella pertussis Tohama I ve Saadet suşuna ait PPIase, POMP ve FIMX genlerinin klonlanması. 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (13-16 Aralık 2009, Antalya) Bildiri Kitabı, sayfa: 71-72.

      6. Abanoz, B., Kurt Kızıldoğan, A., Okay, S. (2015). Türkiye`deki üç farklı tuz kaynağından ekstrem halofilik bakteri izolasyonu. Ekoloji 2015 Sempozyumu (6-9 Mayıs 2015, Sinop). Bildiri Özet Kitapçığı sayfa 427.

      7. Okay, S., Karabulut, F., Çetin, R., Doğan, C., Kurt Kızıldoğan, A., Sürücüoğlu, S. (2015). Mycobacterium tuberculosis’in erp, hspR, lppX, mmA4 ve ompA genlerinin Escherichia coli’ye klonlanması. 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (18-19 Aralık 2015, Konya). Bildiriler Kitabı sayfa 284.

      8. Abanoz, B., Baş, L., Otur, Ç., Okay, S., Kurt Kızıldoğan, A. (2015). Streptomyces clavuligerus’a demir regülasyonunda rol alması muhtemel üç regülatör genin antibiyotik direnç genleriyle tahrip edilmesi. 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (18-19 Aralık 2015, Konya). Bildiriler Kitabı sayfa 214.

      Kitap Bölümü:

      1. Okay, S. (2016). “Identification of gene families using genomics and/or transcriptomics data”, in Plant Omics-Trends and Applications. Eds: K. Hakeem, H. Tombuloglu, G. Tombuloglu. Springer. pp. 217-254. ISBN: 9783319317014

      2. Eldem, V., Okay, S., Bakir, Y., Unver, T. (2015) “Chapter 6: Antimicrobial polypeptides in the control of plant pathogenic bacteria” in Sustainable Approaches to Controlling Plant Pathogenic Bacteria. Eds: V. Rajesh Kannan, Kubilay Kurtulus Bastas. pp. 123-148. CRC Press, Taylor&Francis Group

      3. Okay, S. (2015) "Bölüm 17. Boşaltım Sistemi", Schaum`s Outlines: Biyoloji (4. baskıdan çeviri), Ed: Mehmet Karataş, pp. 236-248. Nobel Yayınevi

      4. Okay, S. (2010) “Determination of the base composition of DNA from its thermal denaturation temperature” in Molecular and Cellular Biology II Laboratory Manual. Ed: Semra Kocabıyık, pp. 36-39. Department of Molecular Biology and Genetics, Middle East Technical University.

      Bilimsel Dergilerde Editörlük:

      • Jacobs-Cell and Molecular Biology
      • SM Journal of Biology (SMJB)
      • Turkish Journal of Biology (Konuk Editör)


      Bilimsel Dergilerde Hakemlik:

      • Acta Physiologiae Plantarum
      • Biocontrol Science and Technology
      • Bioengineered Bugs
      • Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
      • BMC Genomics
      • BMC Plant Biology
      • Enzyme Engineering
      • International Journal of Plant Genomics
      • Journal of Veterinary Medicine and Animal Health
      • Plant Biology
      • Plant Cell Reports
      • Plant Gene
      • Plant Molecular Biology
      • PLoS ONE
      • Turkish Journal of Agriculture - Food Science and Technology
      • Turkish Journal of Agriculture and Forestry
      • Turkish Journal of Biochemistry
      • Turkish Journal of Biology
      • Turkish Journal of Botany
      • World Journal of Agricultural Sciences


      Sertifikalar:

      • Deney Hayvanı Kullanım Sertifikası
      • Temel Hücre Kültürü ve Kök Hücre Kursu Sertifikası
      • Temel Biyoistatistik Kursu Sertifikası


      Bilimsel Kuruluşlara Üyelik:

      • Biyoteknoloji Derneği
      • Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti
      • Moleküler Biyoloji Derneği

      Sivil Toplum Kuruluşlarında Görev Alma:

      • TEMA Vakfı Çankırı İl Temsilcisi (Ağustos 2013-Devam)

      Ödüller:

      • Lisans Eğitimi Bölüm Birinciliği, Anadolu Üniversitesi, Haziran 2002
      • Doktora Eğitimi Ders Performans Ödülü, ODTÜ 2005-2006 Eğitim Yılı
      • TÜBİTAK Uluslararası Bilimsel Yayın Teşvik Ödülleri, 2005, 2008, 2011, 2012, 2015
      • ODTÜ Bilimsel Yayın Ödülleri, 2008
      • VetPath Konferansı Seyahat Ödülü, Prato, İtalya, 6-9 Ekim 2010

      İletişim

      Adres:
      Çankırı Karatekin Üniversitesi
      Fen Fakültesi
      Biyoloji Bölümü
      18100 ÇANKIRI

      E-posta:
      sezerokay@yahoo.com
      sezerokay@gmail.com

      Web:
      https://www.researchgate.net/profile/Sezer_Okay

      https://karatekin.academia.edu/SezerOKAY

      CV (English)

      Assoc. Prof. Dr. Sezer OKAY

      Faculty of Science

      Department of Biology


      Education:

      B.Sc., Department of Biology, Faculty of Science, Anadolu University, Eskisehir, TURKEY.

      M.Sc., Institute of Natural and Applied Sciences, Biology Program, Middle East Technical University, Ankara, TURKEY.

      Ph.D., Institute of Natural and Applied Sciences, Biology Program, Middle East Technical University, Ankara, TURKEY.

      Academic and Professional Positions:

      Research/Teaching Assistant in Department of Biological Sciences, Middle East Technical University, Ankara, TURKEY.

      Visiting Researcher in CReSA, Universitat Autonoma de Barcelona (UAB), Barcelona, SPAIN.

      Research/Teaching Assistant (Dr.) in Department of Biology, Faculty of Science, Atatürk University, Erzurum, TURKEY.

      Assist. Prof. Dr. in Molecular Biology Section, Department of Biology, Faculty of Science, Çankırı Karatekin University, Çankırı, TURKEY.

      Assoc. Prof. Dr. in Molecular Biology Section, Department of Biology, Faculty of Science, Çankırı Karatekin University, Çankırı, TURKEY.

      Administrative Duty:

      2016-Ongoing: Manager of Cankiri Karatekin University Research Center (CANKAM).

      Professional Experience:

      • Genetic engineering
      • Genomics, Transcriptomics and Bioinformatics
      • Protein and enzyme studies
      • Recombinant vaccine development and detection of immune response

      Lectures Given:

      Undergrad:

      • BİY151 General Biology Lab. I (Must)
      • BİY152 General Biology Lab. II (Must)
      • BİY309 Biochemistry I (Must)
      • BİY302 Genetics II (Must)
      • BİY307 Molecular Biology I (Must)
      • BİY425 Biology Research Project I (Must)
      • BİY404 Biology Research Project II (Elective)

      Graduate:

      • BİY547 Metabolic Engineering (Elective)
      • BİY548 Recombinant Vaccine Development (Elective)
      • BİY549 Secondary Metabolites (Elective)

      International Research Activity:

      Studies on DNA vaccine strategies at CReSA (Animal Health Research Center), UAB (Autonomous University of Barcelona), Barcelona, Spain; for one year (supervised by Dr. Fernando Rodriguez).

      Languages:

      Turkish: Native language

      English: Advanced

      Spanish: Intermediate

      Publications:

      Theses:

      Bs Project: Evaluation of mutagenic and antimutagenic properties of oregano (Origanum onites) oil via Ames Test.

      MSc Thesis: Cloning of chitinase A (chiA) gene of Serratia marcescens Bn10 and its expression in Coleoptera-specific Bacillus thuringiensis.

      PhD Thesis: Development of recombinant vaccines composed of PlpE and OmpH from Pasteurella multocida A:3.


      Research Articles:

      1. Ipek, E., Zeytinoglu, H., Okay, S., Tuylu, B.A., Kurkcuoglu M. and Baser, K.H.C. (2005). Genotoxicity and antigenotoxicity of Origanum oil and carvacrol evaluated by Ames Salmonella/microsomal test. Food Chemistry 93(3): 551–556.

      2. Okay, S., Tefon, B.E., Ozkan M. and Ozcengiz, G. (2008). Expression of chitinase A (chiA) gene from a local isolate of Serratia marcescens in Coleoptera-specific Bacillus thuringiensis. Journal of Applied Microbiology 104: 161–170.

      3.Özcengiz, G., Okay, S., Ünsaldı, E., Taşkın, B., Liras, P., Piret, J. (2010). Homologous expression of aspartokinase (ask) gene in Streptomyces clavuligerus and its hom-deleted mutant: Effects on cephamycin C production. Bioengineered Bugs 1 (3): 191-197.

      4. Okay, S.*, Özcengiz, G. (2011). Molecular cloning, characterization and homologous expression of an endochitinase gene from Bacillus thuringiensis serovar morrisoni. Turkish Journal of Biology 35: 1-7.

      5. Okay, S., Özcengiz, E., Gürsel, İ., Özcengiz, G. (2012). Immunogenicity and protective efficacy of the recombinant Pasteurella lipoprotein E and outer membrane protein H from Pasteurella multocida A:3 in mice. Research in Veterinary Science 93: 1261-1265.

      6. Okay, S., Özcengiz, E., Özcengiz, G. (2012). Immune responses against chimeric DNA and protein vaccines composed of PlpEN-OmpH and PlpEC-OmpH from Pasteurella multocida A:3 in mice. Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica 59 (4): 485-498.

      7. Eldem, V., Okay, S., Ünver, T. (2013). Plant microRNAs: New players in functional genomics. Turkish Journal of Agriculture and Forestry 37: 1-21.

      8. Okay, S., Ozdal, M., Kurbanoglu, E. B. (2013). Characterization, antifungal activity and cell immobilization of a chitinase from Serratia marcescens MO-1. Turkish Journal of Biology 37: 639-644.

      9. Ozhuner, E., Eldem, V., Ipek, A., Okay, S., Sakcali, S., Zhang, B., Boke, H., Unver, T. (2013). Boron stress responsive microRNAs and their targets in barley. PLoS ONE 8(3): e59543.

      10. Turktas, M., Inal, B., Okay, S., Erkilic, E.G., Dundar, E., Hernandez, P., Dorado, G., Unver, T. (2013). Nutrition metabolism plays an important role in the alternate bearing of the olive tree (Olea europaea L.). PLoS ONE 8(3): e59876.

      11. Okay, S.*, Derelli, E., Unver, T. (2014). Transcriptome-wide identification of bread wheat WRKY transcription factors in response to drought stress. Molecular Genetics and Genomics 289 (5): 765-781.

      12. Inal, B., Turktas, M., Eren, H., Ilhan, E., Okay, S., Atak, M., Erayman, M., Unver, T. (2014). Genome-wide fungal stress responsive miRNA expression in wheat. Planta 240 (6): 1287-1298.

      13. Eren, H., Pekmezci, M.Y., Okay, S., Turktas, M., Inal, B., Ilhan, E., Atak, M., Erayman, M., Unver, T. (2015). Hexaploid wheat (Triticum aestivum L.) root miRNome analysis in response to salt stress. Annals of Applied Biology 167 (2): 208-216.

      14. Okay, S.*, Kurt Kızıldoğan, A. (2015). Comparative genome analysis of five Pasteurella multocida strains to decipher the diversification in pathogenicity and host specialization. Gene 567: 58-72. DOI: 10.1016/j.gene.2015.04.063

      15. Gurkok, T., Ozhuner, E., Parmaksiz, I., Özcan, S., Turktas, M., İpek, A., Demirtas, I., Okay, S., Unver, T. (2016). Functional characterization of 4`OMT and 7OMT genes in BIA biosynthesis. Frontiers in Plant Science 7: 98. DOI: 10.3389/fpls.2016.00098.

      16. Okay, S. (2016). In silico characterization of the citrate synthase family in Mycobacterium tuberculosis. Turkish Journal of Biochemistry 41 (2): 118–126. DOI: 10.1515/tjb-2016-0019.

      17. Kurt Kızıldoğan, A., Abanoz, B., Okay, S.* (2017). Global transcriptome analysis of Halolamina sp. to decipher the salt tolerance in extremely halophilic archaea. Gene 601: 56-64 DOI: 10.1016/j.gene.2016.11.042.

      International Congress Presentations:

      Oral presentation:

      1. Okay, S., Özcengiz, E., Özcengiz, G. (2010). Development of new vaccine strategies against Pasteurella multocida. Prato Conference on the Pathogenesis of Bacterial Diseases of Animals (6-9 October 2010, Prato, Italy). Abstract Book p. 47.

      2. Okay, S., Kurt Kizildogan, A., Abanoz, B. (2016). Differential gene expression in Halolamina sp. in response to excess salt. The FEBS Journal 283 (Suppl. 1): 89.

      3. Kurt Kizildogan, A., Otur, Ç., Bas, L., Abanoz, B., Okay, S. (2016). Regulation of siderophore biosynthesis by different transcriptional regulators in Streptomyces clavuligerus. The FEBS Journal 283 (Suppl. 1): 83.

      Poster presentations:

      1. Okay, S., Ipek, E., Zeytinoğlu, H., Kurkcuoğlu, M. (2003). Antimutagenicity testing of Origanum oil and carvacrol in the Ames assay. 13th Balkan Biochemical Biophysical Days & Meeting on Metabolic Disorders (October 12-15, 2003 Aydın, Turkey) Programme & Abstracts. Turkish Journal of Biochemistry 28(3): 140.

      2. Okay, S., Ozkan, M. and Ozcengiz, G. (2006). Expression of an endochitinase (chiA) gene from Serratia marcescens Bn10 in a Cry3A producer Bacillus thuringiensis. 2nd FEMS Congress of European Microbiologists (July 4-8, 2006 Madrid, Spain) Abstract Book p.124.

      3. Okay, S. and Ozcengiz, G. (2008). Characterization and homologous expression of endochitinase gene (chi3023) from Bacillus thuringiensis serovar morrisoni. XII. International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology (5-9 August 2008, İstanbul, Turkey) Abstract Book p. 75.

      4. Ünsaldı, E., Okay, S. and Özcengiz, G. (2008). Cephamycin C overproduction upon releasing relaxing precursor flux by genetic engineering and medium formulation. XII. International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology (5-9 August 2008, İstanbul, Turkey) Abstract Book p. 98.

      5. Okay, S., Aragon, V., Rosell, R., Pujols, J., Ozcengiz, G., Rodriguez, F. (2009). Use of FHA from Bordetella bronchiseptica as an adjuvant to improve DNA vaccination in small and large animals. 3rd annual meeting EPIZONE “Crossing borders” (12-15 May 2009, Antalya, Turkey) Abstract Book p.137.

      6. Okay, S., Ünsaldı, E., Taşkın, B., Kurt, A., Piret, J., Liras, P., Özcengiz, G. (2009). Metabolic engineering of aspartate pathway for increased production of cephamycin C in Streptomyces clavuligerus. International Symposium on Biotechnology: Developments and Trends(27-30 September 2009, METU, Ankara, Turkey) Abstract Book p. 99.

      7. Okay, S. (2014). Development of recombinant DNA vaccines. 3rd International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey. (10-12 September 2014, İzmir, Turkey). Abstract Book p. 187.

      8. Okay, S. (2015). Bioinformatic analysis of the citrate synthase proteins in Mycobacterium tuberculosis. 4th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey. (27-29 November 2015, Ankara). Abstract Book p. 76.

      National Congress Presentations:

      Oral presentations:

      1. Okay, S., Özcengiz, G. (2007). Bacillus thuringiensis alttür morrisoni kitinaz geninin karakterizasyonu. 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (28-31 Ekim, Antalya). Bildiri Kitabı Sayfa: 303-304.

      2. Ünsaldı, E., Okay, S., Özcengiz, G. (2009). Yabanıl tip Streptomyces clavuligerus ve hom geni delesyona uğramış mutantında aspartokinaz (ask) geni çoklu kopyasının homolog ekspresyonu: Hücre içi serbest aminoasit seviyesindeki değişimler. 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (13-16 Aralık, Antalya). Bildiri Kitabı Sayfa: 314-317.

      3. Okay, S., Özcengiz, E., Gürsel, İ., Özcengiz, G. (2012). Pasteurella multocida’ya karşı rekombinant aşı geliştirilmesinde farklı adjuvanların rolü. 2. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi (15-18 Kasım, Antalya). Bildiri Özetleri Kitabı sayfa: 52.

      4. Okay, S. (2015). Ulusal rekombinant tüberküloz aşısına ilk adım. 7. Ulusal Mikobakteri sempozyumu (8-10 Mayıs 2015, Mersin). Sempozyum Kitabı sayfa 151.

      5. Okay, S., Kurt Kızıldoğan, A. (2015). Beş farklı Pasteurella multocida suşunun karşılaştırmalı genom analizi. 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (18-19 Aralık 2015, Konya). Bildiriler Kitabı sayfa 260.

      6. Kurt Kızıldoğan, A., Abanoz, B., Okay, S. (2015). Ekstrem halofilik arkeon Haloarcula sp. tarafından üretilen proteaz enziminin karakterizasyonu. 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (18-19 Aralık 2015, Konya). Bildiriler Kitabı sayfa 185.

      7. Okay, S., Kurt Kızıldoğan, A., Abanoz, B. (2016). Ekstrem halofilik arkebakterilerin biyoteknolojik öneme sahip enzim üretimlerinin araştırılması. I. Ulusal Tarımsal Biyoteknoloji Kongresi (1-3 Haziran 2016 Samsun). Bildiri Özetleri Kitabı sayfa 2.

      Poster presentations:

      1. Okay, S., Özkan, M., Özcengiz, G. (2005). Kitinaz A geninin Serratia marcescens`ten klonlanması ve Coleoptera-spesifik Bacillus thuringiensis`te ifade edilmesi. 14. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (31 Ağustos-2 Eylül, Eskişehir) Bildiri ve Poster Kitabı Sayfa: 586.

      2. Okay, S., Tefon, B.E., Özkan, M., Özcengiz, G. (2007). Serratia marcescens Kitinaz A Geninin Rekombinant Bacillus thuringiensis`te Ekspresyonunun Analizi. 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (28-31 Ekim, Antalya). Bildiri Kitabı Sayfa: 44.

      3. Okay, S., Özcengiz, E., Özcengiz, G. (2009). Pasteurella multocida P-1062 suşuna ait ompH geninin klonlanması ve biyoinformatik analizi. 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (13-16 Aralık, Antalya). Bildiri Kitabı Sayfa: 15.

      4. Okay, S., Baloğlu, M.C., Eroğlu, A., Battal, A., Özcengiz, G., Öktem, H.A., Yücel, M. (2009). Serratia marcescens’e ait kitinaz A geninin tütün bitkisine aktarılması. 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (13-16 Aralık, Antalya). Bildiri Kitabı Sayfa: 14-15.

      5. Yılmaz, Ç., Okay, S., Tefon, B. E., Özcengiz, E., Özcengiz, G. (2009). Bordetella pertussis Tohama I ve Saadet suşuna aitPPIase, POMPve FIMXgenlerinin klonlanması. 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (13-16 Aralık 2009, Antalya) Bildiri Kitabı, sayfa: 71-72.

      6. Abanoz, B., Kurt Kızıldoğan, A., Okay, S. (2015). Türkiye`deki üç farklı tuz kaynağından ekstrem halofilik bakteri izolasyonu. Ekoloji 2015 Sempozyumu (6-9 Mayıs 2015, Sinop). Bildiri Özet Kitapçığı sayfa 427.

      7. Okay, S., Karabulut, F., Çetin, R., Doğan, C., Kurt Kızıldoğan, A., Sürücüoğlu, S. (2015). Mycobacterium tuberculosis’in erp, hspR, lppX, mmA4 ve ompA genlerinin Escherichia coli’ye klonlanması. 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (18-19 Aralık 2015, Konya). Bildiriler Kitabı sayfa 284.

      8. Abanoz, B., Baş, L., Otur, Ç., Okay, S., Kurt Kızıldoğan, A. (2015). Streptomyces clavuligerus’a demir regülasyonunda rol alması muhtemel üç regülatör genin antibiyotik direnç genleriyle tahrip edilmesi. 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi (18-19 Aralık 2015, Konya). Bildiriler Kitabı sayfa 214.


      Book chapter:

      1.Okay, S. (2016). “Identification of gene families using genomics and/or transcriptomics data”, in Plant Omics-Trends and Applications. Eds: K. Hakeem, H. Tombuloglu, G. Tombuloglu. Springer. pp. 217-254. ISBN: 9783319317014

      2. Eldem, V., Okay, S., Bakir, Y., Unver, T. (2015) “Chapter 6: Antimicrobial polypeptides in the control of plant pathogenic bacteria” in Sustainable Approaches to Controlling Plant Pathogenic Bacteria. Eds: V. Rajesh Kannan, Kubilay Kurtulus Bastas. pp. 123-148. CRC Press, Taylor&Francis Group

      3. Okay, S. (2015) "Bölüm 17. Boşaltım Sistemi", Schaum`s Outlines: Biyoloji (Translation from 4th Edition), Ed: Mehmet Karataş, pp. 236-248. Nobel Press

      4. Okay, S. (2010) “Determination of the base composition of DNA from its thermal denaturation temperature” in Molecular and Cellular Biology II Laboratory Manual. Ed: Semra Kocabıyık, pp. 36-39. Department of Molecular Biology and Genetics, Middle East Technical University.

      Editor in Scientific Journals:

      • Jacobs-Cell and Molecular Biology
      • SM Journal of Biology (SMJB)
      • Turkish Journal of Biology (Guest Editor)


      Reviewer in Scientific Journals:

      • Acta Physiologiae Plantarum
      • Biocontrol Science and Technology
      • Bioengineered Bugs
      • Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
      • BMC Genomics
      • BMC Plant Biology
      • Enzyme Engineering
      • International Journal of Plant Genomics
      • Journal of Veterinary Medicine and Animal Health
      • Plant Biology
      • Plant Cell Reports
      • Plant Gene
      • Plant Molecular Biology
      • PLoS ONE
      • Turkish Journal of Agriculture - Food Science and Technology
      • Turkish Journal of Agriculture and Forestry
      • Turkish Journal of Biochemistry
      • Turkish Journal of Biology
      • Turkish Journal of Botany
      • World Journal of Agricultural Sciences


      Certificates:

      • Certificate for Utilization of Experimental Animals (02.12.2011, GATA, Ankara)
      • Basic Cell Culture and Stem Cell Course Certificate (26.11.2011, GATA, Ankara)
      • Basic Biostatistics Course Certificate (27.11.2011, GATA, Ankara)


      Membership to Scientific Organizations:

      • Biotechnology Association in Turkey
      • Turkish Society for Microbiology
      • Molecular Biology Association


      Role in Non-Governmental Organizations:

      • Provincial representative of TEMA Foundation (Turkish Foundation of Struggling against Erosion and Afforestation, and Preservation of Natural Resources) (August 2013-Present)


      Awards:

      • Bsc educationHigh Honor Degree, Anadolu University, June 2002
      • Graduate Courses Performance Award, METU, 2005-2006 Academic Year
      • TÜBİTAK International Scientific Publication Awards, 2005, 2008, 2011, 2012, 2015
      • METU Scientific Publication Award, 2008
      • Travel Award, VetPath Conference, Prato Italy, 6-9 October 2010